Флот тупо существует на века дольше авиации. И организовался изначально как ниибаца серьёзная авторитарная система, а не развлечение кучки великовозрастной студентоты, к которой для выпаса приставили восторженных офицеров. За век-другой и авиация обзаведётся своими традициями.

С флотом у космических сил есть много общего.
Конструктивно современные космические мусорные баки ближе к самолётам. Примерно как самолёты начала прошлого века были конструктивно ближе к автомобилям, хе.Только сейчас самое крупное космическое летало не сильно больше атмосферного истребителя, а по водоплавающим меркам вообще шаланда.
Но космооперные космические корабли уже не самолёты. Самый крупный самолёт - штука не самодостаточная и не автономная. Он стоит на базе, взлетает, выполняет задание максимум за сутки и садится снова. После чего его облепляют матросы техники и начинают драить медяшку проводить техническое обслуживание. В полёте самолёт можно максимум дозаправить и исправить мелкие неполадки в кабине, но не до/переоснастить и не починить проблемы вроде заклинившего двигателя или оторванного куска обшивки.
Корабль же может находиться в пустом месте месяцами, везя запасы с собой или получая их транспортами. Повреждения вплоть до дырок в обшивке и отказа половины двигателя — залатать своими силами, максимум при помощи ремонтного корабля. Потому что всегда есть возможность кораблю лечь в дрейф, а матросам техникам выйти наружу и спокойно облазить весь корпус. Живут они не на базе, а на корабле же.
К подводным лодкам космический корабль тоже технически близок. Снаружи — недружелюбная среда, в которой выжить очень сложно, а добраться отдельно от корабля до куда-либо вовсе невозможно. Для самолёта разгерметизация например есть временная проблема, всегда можно спуститься пониже, надеть кислородную маску, катапультироваться наконец. В лодке и корабле дырявый отсек становится непригоден для жизни, но экипаж может или чинить своими силами, или дойти до базы, но только все вместе.
Прочный корпус у космического корабля таки есть. Герметичный корпус жилых отсеков же, стенки мусорного бака. Мусорным бакам лёгкий корпус обычно не нужен, хотя зайчатками его можно считать тряпчатые чехлы на манипуляторах. Но когда появится броня, она будет именно им. Снаружи обтекаемый и закрывающий почти со всех сторон негерметичный панцирь, под ним некритичное оборудование вроде топливных баков, орудий с боезапасом и самогонных аппаратов, в середине атмосферный отсек экипажа и тоже герметичный отсек реактора.
Субординация и единовластие капитана и там и там обоснованны одинаково — жизнь корабля и всех на борту зависит от каждого члена экипажа, потому каждый должен делать то, что должен. Деваться некуда. Ну и такого понятия как "команда" на самолёте вообще нет, не живут там десятки человек в ограниченном пространстве месяцами.

Именно флотские традиции в космосе, конечно, не приживутся. Они и на флоте-то уже неприживаются. Но и исключительно авиационным состав космических сил не будет.
Пилоты будут из лётчиков. Хотя капитальному космическому кораблю как таковой пилот не особо нужен, не совершает эта туша резких маневров, а совершает только плавные, и управление ей больше навигация, чем пилотирование. А вот операторы вооружения и электроники - флотские. Потому что нет ни на каком самолёте многих точек разнокалиберного вооружения и сенсоров
Реактивные двигатели тоже ближе к авиационному конструированию, как и аэродинамика (для небольших судов). Но крупные корабли в доках умеют строить только моряки, и проектировать каркас с отсеками будут с их помощью.
С управлением же, я считаю, проще научить морского капитана думать ускорением в трёх измерениях, чем заставить пилота пыриться в экран автопилота неделями и считать курс заранее, без возможности его изменить влюбой момент.